Pour garantir un suivi efficace des formations en apprentissage, la MCPFA s’appuie sur une organisation structurée à l’échelle académique. Cette organisation permet une coordination entre les différents acteurs du contrôle pédagogique.

Le contrôle pédagogique est coordonné au niveau académique par un inspecteur coordonnateur, nommé par le recteur d'académie. Il est responsable :

• de la mise en œuvre du plan annuel de contrôle,
• du traitement des saisines et signalements,
• du lien avec les autres services académiques (le service des examens par exemple).

La mission est assurée par des inspecteurs de l’Éducation nationale (IEN), des inspecteurs pédagogiques régionaux (IA-IPR), et des experts désignés par les chambres consulaires et par les commissions paritaires régionales (ou nationales) pour l'emploi et la formation (CPRE / CPNE). Ils interviennent selon leur champ disciplinaire sur l’ensemble des diplômes concernés.

Toutes les demandes, signalements ou sollicitations doivent être adressés via le formulaire en ligne, qui assure leur transmission aux personnes compétentes selon la nature du dossier.